Problem wyginięcia niektórych zwierząt nie jest ostatnim miejscem w teorii ewolucji i ma pierwszorzędne znaczenie w nauczaniu darwinowskim. Liczba żyjących obecnie gatunków zajmuje tylko znikomą część ogólnej liczby zwierząt, które kiedykolwiek pojawiły się na planecie (mniej niż 1%). 99% kategorii w końcu wymarło, a przyczyn tego jest wiele.
Najbardziej podatne na wyginięcie są zwierzęta znalezione w jednym lub kilku miejscach na obszarach ograniczonych geograficznie. Jeśli cały zasięg przeszedł działalność człowieka, to żyjące w nim gatunki mogą zniknąć. Bezpośrednią przyczyną wymierania niektórych gatunków zwierząt w warunkach naturalnych jest spadek ich liczebności poniżej poziomu krytycznego, określonego prawami genetyki populacyjnej. Krytyczny jest poziom liczebności, poniżej którego staje się duża możliwość krzyżowania blisko spokrewnionego, co prowadzi do zmniejszenia różnorodności genetycznej gatunków. W rezultacie istnieje odsetek potomstwa z wadami wrodzonymi, które zwiększają śmiertelność w nowych pokoleniach. Gatunki, które powstały w wyniku jednej lub więcej populacji, również podlegają szybkiemu wyginięciu. Każda kategoria może zniknąć w wyniku pożarów, trzęsień ziemi, chorób i działalności człowieka. Kategorie z różnymi populacjami są mniej podatne na wyginięcie. W porównaniu z małymi, duże zwierzęta mają ogromne terytoria indywidualne. Potrzebują dużo jedzenia i często stają się ofiarami dla ludzi. Duże zwierzęta są bardziej podatne na eksterminację nie tylko dlatego, że są ofiarami, ale także dlatego, że konkurują z ludźmi w polowaniu na zwierzynę, czasami atakują ludzi i zwierzęta gospodarskie. Są populacje zwierząt, które żywią się na dużych obszarach. Są również podatne na wyginięcie, pod warunkiem, że zniszczona zostanie część ich zasięgu. Wraz z naturalnym rozwojem przyrody zmiany środowiskowe wymuszają na niektórych kategoriach przystosowanie się do nowych warunków. Zwierzęta niezdolne do adaptacji zmuszone są do migracji do odpowiednich siedlisk. W przeciwnym razie ich gatunek jest zagrożony wyginięciem. Szybkie tempo rozwoju zasobów naturalnych wyprzedza adaptację, pozostawiając migrację jako jedyną opcję. Kategorie zwierząt, które nie mogą przejść przez pola, drogi i inne naruszone siedliska, są skazane na wyginięcie. Utylitaryzm zawsze był warunkiem wyginięcia bardzo cennych gatunków zwierząt. Nadmierna eksploatacja może drastycznie zmniejszyć liczebność populacji. Jeśli polowanie nie jest regulowane przez prawo, niektóre gatunki zwierząt mogą być na skraju wyginięcia.
